El Programa de Magíster en Administración de Empresas se crea respondiendo a las necesidades de las empresas y organizaciones de la zona de Concepción de mejorar las competencias profesionales en el área de la gestión de los profesionales que ya cuentan con experiencia de trabajo y un título profesional o grado académico previo. A la fecha el Magíster en Administración de Empresas ha graduado a 181 profesionales provenientes de distintas regiones del país y de otros países, tanto de América como de Europa. En la actualidad tiene 29 alumnos regulares. El Programa cuenta con un cuerpo académico conformado por 14 profesores acreditados por la Dirección de Postgrado como profesores Responsables de Asignatura. De ellos, 11 pertenecen a la Facultad de Ciencias Económicas y Administrativas y 3 a otros Departamentos/Facultades de la Universidad.