El principal objetivo del Máster es la formación de especialistas en el desarrollo y la aplicación de métodos de análisis que emplean las técnicas cromatográficas para la resolución de problemas analíticos en diferentes sectores industriales (agroalimentario, petroquímico, farmacéutico, etc.), en control de la contaminación, en biomedicina, etc. También figura entre sus objetivos facilitar la inserción laboral de los licenciados en Química, Bioquímica, etc. en el sector industrial, así como proporcionar al alumno el conocimiento de las últimas tendencias en las técnicas cromatográficas e iniciarlo en la investigación en el ámbito de las técnicas mencionadas.