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Introducción a la Bioinformática

Introducción a la Bioinformática

IUCT - Institut Universitari de Ciència i Tecnologia.

Curso presencial

Mollet Del Valles (Barcelona)


620
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Fecha inicio

Mollet Del Valles

A quién va dirigido

Licenciados, graduados, técnicos o trabajadores del sector interesados en el área de la biotecnología.

Temario completo de este curso

INTRODUCCIÓN A LA INFORMÁTICA (5H)

- Intentando definir la bioinformática
- Relevancia actual de la bioinformática
- Formatos de ficheros y bases de datos
- Proveedores institucionales de datos
- Herramientas locales y de internet

HERRAMIENTAS COMPUTACIONALES (24H)

- Sistemas operativos alternativos: introducción a unix/linux
- Órdenes en línea de comandos y filosofía de órdenes encadenadas (pipes)
- Lenguajes de programación: Perl como ejemplo
- Estructuras de datos, entrada/salida y funciones en Perl
- Herramientas estadísticas: R como ejemplo
- Librerías específicas de bioinformática: Bioconductor como ejemplo
- Gestores de bases de datos: SQL como ejemplo
- Detrás de las páginas web: HTML, Formularios, CGI, PHP, gestores de contenidos

ALGORITMOS (6H)

- Búsqueda de patrones en secuencias
- Alineamiento de secuencias: Dotplots y programación dinámica
- Algoritmos heurísticos: FastA, BLAST y Clustal

BIOINFORMÁTICA APLICADA (15H)

- Análisis de secuencias genómicas (FastA y BLAST)
- Más allá de BLAST: Prosite (búsqueda de patrones)
- Transcriptómica (microarrays y qRT-PCR)
- Minería en datos masivos (high throughput screening)
- Biología de sistemas: Gene Ontology database (GO)

- Análisis de la variación (polimorfismos)
- Análisis de las relaciones evolutivas (filogenias)
- Biología estructural tridimensional: PDB

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